黑群晖是非官方的产品，所搭载的操作系统是经第三方人员修改后用非官方的方式安装，并未经群晖官方支持。黑群晖虽然在形式上实现了和群晖类似的功能，但是由于硬件是自己搭建，系统由未知来源的第三方提供，若不够专业的第三方搭建，或者自己不太熟悉软件和硬件就会隐藏着巨大隐患。